Импорт Экспорт????

т.е. состояние склада может храниться в карточке товара в базе данных, так и во внешнем файле 1С.

Насчет внешнего файла - я написал, а вот каким образом данные по остаткам сторонних программ будут попадать в карточку товара при выборе хранения в БД MySQL или Files - это каждый решает по своему и не входит в мою компетенцию.

Это может быть адаптации самой программы, либо написание отдельного модуля для обработки файлов остатков данной программы.