Склад

не понял 2 таблицы с остатками?
есть ли поля по которым можно синхронизировать.
судя по настройкам все не верно настроено.
если скалада 2 то то надо делать либо интеграцию, обратитесь в студию фронтир fronteer.ru
или показывать 2 склада людям но настраивать. в базе товаров должны быть синхрополя (например артикул) которые есть в таблице складской)